許明金認為，影響農村水環境的主要有5個方面的因素：一是生活污水和固體廢棄物污染；二是農業種植污染；三是中小型鄉鎮企業排放；四是集約化養殖場和畜禽養殖；五是農村水處理設施短缺。

由于農村人口分散、人口數量多，生活污水及各種洗滌水和人畜糞便等，都直接排入河流、湖泊，造成水體污染，引發傳染病的流行，威脅村民身體健康。

許明金建議，一是大力加強農村的環境保護教育，提高農民的環境保護意識，使農民充分認識“先污染後治理”的嚴重後果，切實處理好發展與環境的關系。二是統籌鄉鎮企業規劃、合理布局，使鄉鎮企業向工業園區集中，使污染源集中，将企業排放的污水集中處理。三是集中處理生活廢水，加強農村生活污水收集、處理與資源化設施建設，避免因生活污水直接排放而引起的農村水體、土壤、農産品污染，确保農村水源安全和農民身心健康。四是推廣先進農業科學技術，實現增加農民收入，保護環境，使農業可持續發展。五是加強養殖污染物處理合理布局，使畜禽養殖場地遠離居民區，遠離居民水源地。六是積極推動農村環境保護基礎設施建設，加快農村污水處理、垃圾處理、改水改廁等基礎工程建設，使污水和廢棄物有效處理，切斷水體污染源。